Podłoga do pomieszczeń czystych jest ważnym czynnikiem podczas projektowania pomieszczeń czystych.Został zaprojektowany w celu zminimalizowania wytwarzania cząstek stałych, ułatwienia czyszczenia i utrzymania integralności środowiska w pomieszczeniu czystym.Najpopularniejsze materiały podłogowe stosowane w pomieszczeniach czystych to winyl, żywica epoksydowa i poliuretan.

Struktura podłogi do pomieszczeń czystych zazwyczaj składa się z podłoża, warstwy kleju i wierzchniej warstwy materiału podłogowego.Warstwa wierzchnia materiału podłogowego powinna być dobrana w oparciu o klasę pomieszczenia czystego i zastosowanie, a także trwałość i łatwość czyszczenia.Wszystkie materiały podłogowe powinny nie osypywać się, nie strzępić i być odporne na uszkodzenia powodowane przez środki czyszczące.

Aby utrzymać czystość podłogi w pomieszczeniu czystym, ważne jest przestrzeganie harmonogramu regularnego czyszczenia i konserwacji.W zależności od poziomu aktywności i rodzaju obecnych zanieczyszczeń częstotliwość czyszczenia i konserwacji może się różnić.Wszelkie czyszczenie powinno być wykonywane przy użyciu specjalistycznego sprzętu i środków czyszczących, a wszelkie naprawy lub wymiany podłóg powinny być wykonywane przez przeszkolonych profesjonalistów.