Czystość jest istotnym czynnikiem decydującym o skuteczności szafy bezpieczeństwa biologicznego.Regularne czyszczenie pomaga utrzymać czystość, zmniejszając potencjalne rozprzestrzenianie się szkodliwych cząstek, bakterii i innych zanieczyszczeń.

Materiały użyte do budowy szaf bezpieczeństwa biologicznego muszą być odporne na korozję, łatwe do czyszczenia i nieporowate, aby zapobiec rozwojowi bakterii.Materiały muszą być również wystarczająco trwałe, aby wytrzymać wymagane procedury czyszczenia i odkażania.

Cały BSC musi spełniać określone normy międzynarodowe, w tym ISO 14644-1 i EN1822.Szafy muszą być regularnie testowane, a odpowiednia dokumentacja testów i czyszczenia powinna być dostępna na żądanie.

Czystość i materiały użyte do budowy szafy są jednym z najważniejszych czynników zapewniających powodzenie i bezpieczeństwo przeprowadzanych eksperymentów.