1. Małe wentylatory przepychają powietrze przez filtry.Jednostki często mają regulowaną kontrolę prędkości i zwykle zużywają energię przy pełnej prędkości w zakresie 190 - 250 watów.Nowsze instalacje wykorzystują bardziej wydajne silniki prądu stałego.

2. Główną zaletą systemu FFU jest prostota i systemy te są bardzo popularne w małych pomieszczeniach czystych.Jednak FFU zapewnia kwantowy przepływ w przestrzeni sufitu 2'x4 '.Natężenie przepływu i prędkość nie są zmiennymi niezależnymi i dlatego nie nadają się do efektywnego projektowania dla prawidłowego rozprowadzenia przepływu powietrza.

3. Filtry wentylatorów są dość drogie.Mimo że koszt jednostkowy jednostki filtrującej wentylator jest niski, typowy moduł do pomieszczeń czystych będzie wymagał wielu takich jednostek;a łączny koszt szybko przekracza koszt scentralizowanego systemu RAH.

4. Wentylatory-filtry wymagają większych kanałów powietrza w celu zmniejszenia strat ciśnienia statycznego.Zwiększa to zarówno całkowitą szerokość, jak i wysokość budynku.

5. Wentylatory filtrujące można montować w suficie z uszczelkami.Inne opcje będą na ogół wyposażone w ciśnieniowe komory zasilające, które wymagają sufitu z szynami żelowymi.

6. Koszt dystrybucji energii elektrycznej jest najwyższy w przypadku jednostek filtrujących wentylator.Chociaż silniki są znacznie mniejsze, jest ich znacznie więcej.Również koszty automatyzacji są wyższe w przypadku jednostek filtrujących wentylatory, również z powodu dużej ilości wentylatorów.

7. Wentylatory z filtrem rozproszonym na suficie nie wytwarzają dużego ciśnienia statycznego, dlatego często w połączeniu z FFU wymagane są niestandardowe centrale wentylacyjne lub wentylatory wspomagające.System nie umożliwia podwójnej filtracji HEPA.

8. Poziom hałasu z typowego FFU jest niski i wynosi 53dba przy prędkości czołowej 90 FPM.Jednak użycie wielu wentylatorów (w niektórych przypadkach setek) może powodować znaczny poziom hałasu emitowany do pomieszczenia czystego.

9. Stosowanie wielu wentylatorów wymaga zastosowania elektronicznego systemu monitorującego do sprawdzania stanu każdego silnika.